Les substances spécifiques sont des substances pour lesquelles il a été constaté qu'elles entrent dans des quantités significantes dans le bassin versant ou dans une partie de celui-ci. L'évaluation quantitative est réalisée au moyen de normes de qualité environmentale, fixées par les état membres de l'UE. Au Luxemburg, les substances et les normes de qualité y relatives (moyennes annuelles) sont reprises dans le règlement grand-ducal du 15 janvier 2016 concernant l'évaluation des masses d'eau de surface. L'évaluation se fait avec 2 classes (bien, moyen et pire). Les substances spécifiques sont prises en considération pour l'évaluation de l'état écologique, ensemble avec les paramètres physico-chimiques généraux.