Phytoplankton ist eine von vier biologischen Qualitätskomponenten, die bei der Bewertung des ökologischen Zustands/Potenzials der Oberflächenwasserkörper berücksichtigt werden. Die Bewertung erfolgt in 5 Klassen: sehr gut (blau) - gut (grün) - mässig (gelb) - unbefriedigend (orange) - schlecht (rot). Die Bewertung der Qualitätskomponente Phytoplankton ist nur für die planktonführenden, großen Fließgewässer relevant sowie die als erheblich verändert (HMWB) ausgewiesenen Wasserkörper, die eine Stehgewässerausprägung aufweisen. Phytoplankton wird somit ausschließlich in Oberflächenwasserkörpern vom Typ VI beprobt, da die übrigen Gewässertypen keine ausreichenden Konzentrationen an Phytoplankton aufweisen, sowie in den beiden HMWB Sauer (OWK III-2.2.1) und Our (V-1.2) und dies mit einer jährlichen Frequenz von 6 Proben zwischen April und Oktober.